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Whole genome sequence analysis of Shigella from Malawi identifies fluoroquinolone resistance

Article scientifique 2020 Anglais

Résumé

Abstract Increasing antimicrobial resistance and limited alternative treatments led to fluoroquinolone resistant Shigella strain inclusion on the WHO global priority pathogens list. In this study we characterised multiple Shigella isolates from Malawi with whole genome sequence analysis, identifying the acquirable fluoroquinolone resistance determinant qnrS1 .

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Stenhouse, G. E., Jere, K. C., Peno, C., Bengtsson, R. J., Chinyama, E., Mandolo, J., Cain, A. K., Iturriza‐Gómara, M., Bar‐Zeev, N., Cunliffe, N. A., Cornick, J., & Baker, K. S. (2020). Whole genome sequence analysis of Shigella from Malawi identifies fluoroquinolone resistance. bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory). https://doi.org/10.1101/2020.11.20.391235

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Auteur(s)

George E. Stenhouse Khuzwayo C. Jere Chikondi Peno Rebecca J. Bengtsson End Chinyama Jonathan Mandolo Amy K. Cain Miren Iturriza‐Gómara Naor Bar‐Zeev Nigel A. Cunliffe Jennifer Cornick Kate S. Baker

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